Un industriel japonais, sous l'influence de la mode américaine, a décidé de commencer à construire des abris atomiques individuels, mais ils n'ont pas pu établir une production de masse, et le seul abri construit a été abandonné. Cinq ans plus tard, l'entreprise de construction, utilisant le bunker comme fondation, a érigé un bâtiment de trois étages, dont l'arrière était adjacent à la pente. Dans cette maison s'est installé un homme qui a volontairement quitté la société. Dans un passé récent, il était le secrétaire personnel d'un célèbre politicien, a épousé sa fille et fait de la publicité pour des abris atomiques dans une entreprise de construction que son beau-père contrôlait.
Mais un beau jour, il a enlevé à sa femme un fils de cinq ans, que les médecins considéraient comme mentalement retardé, et a commencé à vivre avec l'enfant en reclus dans un refuge. Il s'est nommé lui-même l'avocat de ceux qu'il aimait le plus dans ce monde - les arbres et les baleines. Il a changé son nom pour souligner sa nouvelle essence, et a commencé à s'appeler Ooki ("arbre puissant") Isana ("poisson courageux"). Il est en train de regarder des photos de baleines, regardant à travers des jumelles les arbres qui poussent à l'extérieur. Pour être plus proche de la nature, il a fait un trou dans le plancher du bunker de 30 × 30 centimètres et plonge dans la pensée, posant ses pieds nus sur la vraie terre. Isana a enregistré les voix de divers oiseaux et son fils Dzin a appris à les reconnaître avec précision: il s'est avéré que le garçon avait une ouïe inhabituelle.
Une fois qu'un incident se produit dans une plaine marécageuse visible depuis les fenêtres d'un abri. Une jeune fille séduit un agent de police et ses amis l'attaquent et emportent le pistolet. Pour se sauver, l'agent sélectionne le plus faible des assaillants et, ayant réussi, lui met une menotte sur la main, tandis qu'il clique sur la deuxième menotte de sa main. Des adolescents ont battu l'agent et le garçon essaie de lui couper la main pour s'échapper. Un agent de police détache les menottes et s'enfuit, et les adolescents crient après lui pendant longtemps.
Voyant que les arbres étaient couverts de jeunes feuillages et ont acquis une sensation de sécurité totale, Isana, spirituellement liée à eux, se sent également protégée et quitte l'abri. Comme les plantes, il se réveille de l'hibernation et cherche une issue pour l'énergie qui s'est accumulée en lui. Avec Jin, il monte dans le bus et se rend au parc, mais ils arrivent trop tard: le parc est déjà fermé et les manèges ne fonctionnent pas. Le gardien les manque néanmoins, et dans un parc désert, ils rencontrent un groupe d'adolescents agressifs, dont l'un a la main bandée. Isana ressent une peur inexplicable et est pressée de retourner au refuge. En allant au magasin et en laissant Jin seul à la maison, Isana éprouve également de la peur. Il fait des cauchemars la nuit. Il a le sentiment que leur refuge est surveillé tout le temps. Une fois qu'il découvre un dessin sur le mur d'une maison - un cercle et une croix. Isana peint à côté de ce motif d'oeil. Il rencontre une fille près de chez lui, qui lui propose de dormir dans le vestiaire de la célèbre actrice dans un studio de cinéma abandonné, un peu plus loin des plaines marécageuses. Isana ne répond rien et part, et la nuit entend le clochard des adolescents sur le toit et s'inquiète pour Jin, dont l'équilibre mental fragile est si facilement bouleversé.
Le lendemain, Isana regarde à travers des jumelles les ruines d'un studio de cinéma et voit une fille nue dans la fenêtre du pavillon. Soudain, il remarque un groupe d'adolescents qui l'accusent de les avoir espionnés. Ils demandent pourquoi Isana et Jin vivent ici sans parler à personne. Isana leur explique qu'il est avocat pour les arbres et les baleines. Après avoir menacé de représailles, les adolescents ont forcé Isan à laisser Boy chez lui, un adolescent dont la blessure commençait à s’aggraver, et Inago, la fille même qui lui a suggéré de coucher avec elle. Isana se rend à la pharmacie pour des médicaments pour le patient, tandis qu'Inago s'occupe de Jin. À la surprise d'Isan, la fille traite le bébé avec soin et attention.
L'un des adolescents, Takaki, parle à Isana du baleinier. Enfant, Takaki a entendu parler de lui, a rêvé de lui, mais ne l'a jamais vu. Le nom "Whale Tree" donne à Isan une sensation chaleureuse, il commence aussi à lui sembler qu'un tel arbre existe. De retour de la pharmacie, Isana tombe du vélo. Les adolescents rient, ne pensant pas du tout qu'il puisse être blessé. Isana s'émerveille de leur cruauté. Takaki arrive pour Isana dans une voiture volée et continue l'histoire du Whale Tree. Quelques jours plus tard, Takaki montre à Isana une cache d'adolescents: ils s'installent dans un studio de cinéma abandonné. Ils ont démonté la goélette, que l'un d'eux était censé garder, l'ont traînée par parties vers l'un des pavillons, et là, ils l'ont ramassée et ont commencé à étudier les affaires maritimes, afin qu'elle puisse plus tard prendre la mer. Les adolescents sont unis dans l'Union des marins libres et vivent ici, équipant les cabines du sous-sol.
Voyant que Takaki a amené Isan, le Garçon, qui avait presque récupéré et est retourné à la goélette, veut tirer sur "cet homme fou": personne d'autre ne devrait être au courant de leur cache. Isana n'a pas peur de la mort: Inago prend tellement soin du garçon qu'il peut se passer de père. Mais Isana doit remplir sa mission - dire aux nouveaux venus d'autres mondes que ce n'est pas l'homme qui a régné sur terre, mais les baleines et les arbres. Le combat a peur qu'Isana les dénonce à la police, mais tous les autres adolescents sont imprégnés de confiance en Isan et lui proposent de les rejoindre.
Un homme surnommé Korotky, qui a déjà quarante ans, de sorte qu'il est encore plus âgé qu'Isan, dit qu'à trente-cinq ans, il a soudainement commencé à rétrécir et continue de rétrécir. En effet, ses membres semblent trop longs par rapport à un corps excessivement court. Il a été envoyé dans un hôpital psychiatrique, mais il s'est échappé de là. Il n'a pas sa place dans le monde des gens ordinaires, et il se sent normal dans une société d'adolescents. En écoutant le raisonnement d'Isan sur les arbres et les baleines, les adolescents en arrivent à la conclusion qu'il a ce qui leur manque: la capacité de mettre leurs pensées en mots. Ils croient que son excellente maîtrise du mot peut leur être utile.
Isana avoue à ses adolescents ses péchés: quand il était secrétaire de son beau-père, il lui a amené des garçons, se livrant à ses perversions. Une fois qu'ils ont accidentellement tué un garçon, et depuis lors, Isana n'a pas connu la paix. En tant que "spécialiste des mots", Isan commence à étudier l'anglais avec des adolescents, choisissant pour cela "Moby Dick" et Dostoevsky dans une traduction anglaise. Au début, il craint que les conversations du vieil homme Zosima semblent trop morales pour les adolescents, mais ils écoutent avec grand intérêt, et le mot «prière» les capture littéralement. À la surprise d'Isan, les adolescents sont devenus très friands de Jin et aimaient écouter de la musique sérieuse. Isana vit en prévision de la fin du monde, et les adolescents attendent le grand tremblement de terre - ils ont beaucoup en commun.
Les adolescents sont attirés par l'Union des marins libres par un soldat des forces d'autodéfense - le bien-aimé Inago. Ils veulent qu'il leur apprenne à manier les armes. Isana demande à sa femme Naobi de trouver un endroit sur la côte où lui et ses amis pourraient vivre deux à trois semaines. Naobi trouve un tel endroit pour eux à Izu, mais là Korotky commet une trahison - il photographie les exercices militaires de l'Union of Free Mariners et vend des photographies à l'hebdomadaire. Il veut forcer les adolescents à le tuer, croyant que le crime les unira et transformera l'Union des marins libres en organisation militaire. Les adolescents organisent un procès de Korotky, au cours duquel l'un d'entre eux - Tamakichi - blesse accidentellement Korotky. Réalisant que la blessure courte est mortelle, les adolescents décident de l'exécuter. Chacun d'eux lui lance une pierre. Isana et le soldat sont séparés. Un soldat, attrapant une mitrailleuse chargée et lançant Inago, s'assoit sur une moto et s'enfuit, les adolescents partent à leur poursuite. L'un d'eux - Tamakichi - lance une grenade sur une goélette de pêche. La goélette s'allume et les soupçons tombent sur le soldat. Un soldat se suicide. Inago devient la maîtresse d'Isan, Isan, Dzini, retour d'Inago à Tokyo, en refuge. Là, ils sont accueillis par des adolescents: ils détruisent un studio de cinéma, ils n'avaient nulle part où aller, et après avoir cassé une fenêtre, ils sont montés dans le refuge d'Isan.
Dans le pavillon du studio de cinéma, il n'y a eu qu'une seule bataille: il n'a jamais accepté de quitter la goélette. Pour qu'elle ne tombe pas entre de mauvaises mains, il explose. Des ouvriers détruisant un studio de cinéma ont battu Boy. Tamakichi emmène le camarade mourant dans une clinique de l'Université de Tokyo et le laisse dans l'arcade. Les adolescents se demandent quoi faire ensuite. Isana demande à Naobi de l'aider à récupérer l'argent pour que le bateau puisse naviguer avec les adolescents. Naobi s'est présentée aux élections et Isana espère qu'il serait plus rentable pour elle que son mari et son fils nagent dans la mer, protégeant les baleines, plutôt que de s'asseoir dans un refuge atomique. Naobi promet d'offrir à l'entreprise de construction d'acheter un abri et un terrain à Isan - les bénéfices seront suffisants pour l'entreprise envisagée. Au cas où les adolescents approvisionneraient en nourriture - s'ils doivent être assiégés, ils en auront besoin dans un abri, mais s'ils doivent naviguer, ils les emmèneront avec eux. Afin de ne pas mettre l'enfant en danger, les adolescents proposent à Isan et Jin de quitter le refuge, mais Isana veut informer sa femme qu'ils et Jin sont pris en otage - alors elle mettra sûrement un navire à leur disposition. Les voitures de police sont visibles depuis la fenêtre de l'abri. Une escouade motorisée a entouré le bâtiment. Des adolescents tirent, la police tire des gaz lacrymogènes. Ils exhortent les assiégés à se rendre.
Les adolescents attendent l'arrivée de la femme d'Isan. Naobi arrive, mais prétend que même au nom de la vie de son enfant, elle ne conclura aucun accord avec des criminels. Les adolescents se battent courageusement, mais le pouvoir n'est pas de leur côté et ils meurent les uns après les autres. Il devient clair qu'ils n'ont plus besoin du navire: ils ne pouvaient toujours pas naviguer, car le navigateur et l'opérateur radio ont été tués. Tamakichi a l'intention de se battre jusqu'au bout, mais il ne veut pas que l'Union des marins libres disparaisse sans laisser de trace. Il invite Takaki à partir et à le ranimer. Isana démissionne en tant que spécialiste selon l'Union of Free Mariners, maintenant il est pleinement engagé dans les fonctions d'avocat des baleines et des arbres. Takaki admet que son histoire sur le baleinier est une fiction, mais Isana objecte que, dès qu'il ne peut pas se rendre chez Takaki et en être convaincu, rien ne l'empêche de croire que le baleinier existe. Takaki avec un drapeau blanc quitte l'abri, suivi par Inago avec Jin dans ses bras et un médecin (un ancien étudiant d'un institut médical). Pendant qu'ils se rendaient à la voiture, la police les a battus.
Lorsque la voiture emporte ceux qui se sont rendus, un camion de pompiers avec une grue monte jusqu'à l'abri et commence à ruiner le bâtiment. Seuls Isana et Tamakiti sont restés dans le refuge. Isana descend au bunker. Posant les pieds sur terre, il écoute le film avec des cris de baleines. L'eau jaillit du sol comme une fontaine: émise par un camion de pompiers, elle s'est infiltrée sous la fondation et s'est bouchée à l'endroit où il y avait un trou dans le sol. Le couvercle du trou d'homme se lève, des coups de feu se font entendre. Isana riposte. L'eau monte de plus en plus. Se tournant vers les âmes des arbres et des baleines, Isana leur envoie le dernier pardon et meurt.